50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5125 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  100 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  57.61 
 
 		 310 aa  343  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  54.67 
 
 		 300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  50.87 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  30.48 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31.58 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.85 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.06 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.5 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.92 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.73 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.47 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  32.63 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.22 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.69 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.69 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.69 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.21 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  28.57 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  32.83 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  28.42 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  30.92 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  26.8 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  27.8 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.28 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.46 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.19 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  23.77 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.41 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.59 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  24.38 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2337  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.58 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 416 aa  45.8  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  23.61 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1637  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.12 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.45 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.15 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.9 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.26 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.31 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1317  hypothetical protein  27.56 
 
 		 209 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2614  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.28 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.11 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.11 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.61 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.01 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.43 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.43 
 
 		 416 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.43 
 
 		 416 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.43 
 
 		 416 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>