57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4280 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  99.36 
 
 		 312 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 		 312 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 		 312 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.74 
 
 		 312 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.42 
 
 		 312 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  80.19 
 
 		 314 aa  531  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.82 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  61.51 
 
 		 331 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  53.14 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  41.72 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.34 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.37 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  39.86 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.45 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.57 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  26.69 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  27.72 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  27.7 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  30.04 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  27.21 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  27.34 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  28.93 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.24 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  26.73 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.09 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.27 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0013  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.91 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.4 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12012  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.57 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.28 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.28 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.18 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3460  amino acid adenylation  22.55 
 
 		 368 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.28 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.57 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0049  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.51 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0293  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.4 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.078094  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0317  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.4 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2887  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.19 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.395919  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  25.79 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.38 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0358  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.98 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3158  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.09 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3292  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.75 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.73 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3664  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25 
 
 		 416 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2702  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.12 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5757  hypothetical protein  28.44 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0029  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.51 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000949111  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.14 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0195  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.12 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  23.86 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0256  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.2 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0229  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.2 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  24.11 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2093  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.51 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0282  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.2 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>