38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0745 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  47.35 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.88 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.86 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.77 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.49 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  36.77 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.83 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.57 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.57 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.57 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.57 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  35.02 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  29.5 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  30.88 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  32.27 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  27.31 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  29.06 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  29.09 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  30.94 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  31.5 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  29.58 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  28.24 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.35 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.75 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.75 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25 
 
 		 364 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.31 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  22.78 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.3 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2288  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.439269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1700  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.28 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0437  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.56 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0071746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.78 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1317  hypothetical protein  24.31 
 
 		 209 aa  42.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>