35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4495 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  100 
 
 		 324 aa  661    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  58.63 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  53.47 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  53.14 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  53.14 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  54.43 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  53.14 
 
 		 312 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  50.31 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  51.96 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  37.75 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  39.19 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.65 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.31 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.15 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  35.02 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  29.07 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  30.11 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  27.8 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  30.7 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  32.68 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  26.1 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  24.43 
 
 		 419 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  24.56 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.26 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  25.85 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3292  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.79 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1975  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.13 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5045  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32923  predicted protein  23.28 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.415774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0452  ribonucleoside-diphosphate reductase 1, beta subunit  25 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0522  ribonucleoside-diphosphate reductase  25.13 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39306  predicted protein  23.57 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.43 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.74 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02075  probable ribonucleoside-diphosphate reductase small chain  22.87 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>