104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0308 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  45.3 
 
 
317 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.84 
 
 
328 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.27 
 
 
331 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.22 
 
 
312 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.94 
 
 
312 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.94 
 
 
314 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.86 
 
 
312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.86 
 
 
312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.94 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.36 
 
 
295 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.36 
 
 
297 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  37.75 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  37.18 
 
 
297 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  36.77 
 
 
302 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  32.63 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  28.41 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  29.43 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  32.29 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  27.46 
 
 
419 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  32.86 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.69 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  28.51 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  27.32 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3292  Ribonucleoside-diphosphate reductase  29.63 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0535  hypothetical protein  30 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1975  Ribonucleoside-diphosphate reductase  30.69 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17523  predicted protein  29.07 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285918  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39306  predicted protein  26.37 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732678  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00067  Ribonucleotide reductase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HEW8]  27.78 
 
 
406 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233826  normal  0.850236 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0013  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.48 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0452  ribonucleoside-diphosphate reductase 1, beta subunit  27.57 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0690  Ribonucleoside-diphosphate reductase  28 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.29 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5045  Ribonucleoside-diphosphate reductase  29.81 
 
 
349 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02075  probable ribonucleoside-diphosphate reductase small chain  29.58 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0522  ribonucleoside-diphosphate reductase  28.97 
 
 
325 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  22.41 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70259  small subunit of ribonucleotide reductase  27.78 
 
 
417 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452888  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39468  predicted protein  27.96 
 
 
346 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.157856  normal  0.124444 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02580  ribonucleoside-diphosphate reductase, putative  26.92 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.01 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.3 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2337  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.38 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32923  predicted protein  25.76 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.415774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.84 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.84 
 
 
344 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  23.81 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.84 
 
 
344 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  24.77 
 
 
370 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  20.6 
 
 
364 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_002620  TC0215  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.37 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0959296  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  21.92 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3046  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.76 
 
 
402 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.74 
 
 
416 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.73 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  23.81 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.57 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2804  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.76 
 
 
400 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  0.329365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2940  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.76 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  21.92 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2636  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.76 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0256  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.43 
 
 
340 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3152  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.58 
 
 
416 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1317  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4305  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.55 
 
 
344 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.64 
 
 
416 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4366  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.91 
 
 
355 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  0.0550239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.97 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3460  amino acid adenylation  22.89 
 
 
368 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0205  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.95 
 
 
394 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000182543  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0229  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.43 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3087  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.76 
 
 
395 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0282  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.43 
 
 
340 aa  45.8  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.11 
 
 
415 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.17 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_002978  WD0212  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.84 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0119093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  23.11 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  26.51 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.11 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.17 
 
 
415 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.11 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.17 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.17 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.25 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0049  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.34 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1975  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.06 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0400777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.17 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2103  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.49 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.197754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3386  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.43 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.49 
 
 
353 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1511  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.21 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2509  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.53 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2469  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.32 
 
 
408 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00438288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.22 
 
 
351 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1763  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.49 
 
 
377 aa  42.7  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.27 
 
 
367 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.27 
 
 
367 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.53 
 
 
376 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0667  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.22 
 
 
420 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0871304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>