63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4131 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  100 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  50.41 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  52.74 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  50.87 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  33.86 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  34.2 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.27 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  32.29 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.58 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.47 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.83 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.04 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.04 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.04 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.65 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.55 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  31.88 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.71 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  32.74 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  30.4 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  30.74 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  28.99 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  27.52 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  25.89 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.62 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.91 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.51 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.51 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.51 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.47 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.51 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.91 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.59 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.59 
 
 		 416 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.96 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.14 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3002  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.86 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.14 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3152  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.14 
 
 		 416 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.14 
 
 		 416 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4609  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.17 
 
 		 360 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.46 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.77 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  21.77 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16400  ribonucleotide reductase, beta subunit  24 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876136  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.48 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  29.09 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.85 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0215  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.69 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0959296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  33 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.3 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.88 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.98 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  24.35 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02075  probable ribonucleoside-diphosphate reductase small chain  22.38 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119718  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39306  predicted protein  22.78 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0535  hypothetical protein  21.77 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.55 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.3 
 
 		 367 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1737  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.59 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.59 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.17 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>