41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5269 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  100 
 
 
419 aa  852    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  37.5 
 
 
306 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  31.09 
 
 
320 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  34.84 
 
 
297 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  34.65 
 
 
317 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  34.84 
 
 
295 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  33.78 
 
 
297 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  27.46 
 
 
308 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.94 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  31.84 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  30.13 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  32.74 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  32.83 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.19 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  29.36 
 
 
300 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.73 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.73 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.73 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  29.25 
 
 
309 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.13 
 
 
331 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.34 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.93 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  24.43 
 
 
324 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.81 
 
 
312 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  28.19 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.55 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.29 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  30.23 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2337  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.42 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  34.29 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  32.43 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  32.43 
 
 
369 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.79 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.31 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2103  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.61 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.197754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5757  hypothetical protein  24.59 
 
 
340 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.04 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  23.04 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0215  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.88 
 
 
346 aa  43.9  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0959296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  35.94 
 
 
363 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.21 
 
 
338 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>