44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1630 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  753    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  59.88 
 
 
366 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  58.55 
 
 
371 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  57.39 
 
 
369 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  57.59 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  54.35 
 
 
360 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  48.5 
 
 
372 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  42.69 
 
 
430 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  39.37 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  39.37 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  39.37 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  39.37 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  39.37 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  40.07 
 
 
306 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  38.15 
 
 
327 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  34.97 
 
 
408 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  37.19 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  29.62 
 
 
373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  27.27 
 
 
369 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  29.62 
 
 
378 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  30.7 
 
 
374 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  23.74 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  26.17 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  24.58 
 
 
303 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  22.76 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  23.4 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  22.78 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  24.13 
 
 
300 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  23.75 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  19.8 
 
 
323 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1906  hypothetical protein  28.03 
 
 
296 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  23.08 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  30.6 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  27.22 
 
 
353 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  26.51 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  25 
 
 
422 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  35.94 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2280  hypothetical protein  25.37 
 
 
251 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.869055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  23.99 
 
 
287 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>