36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2539 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  54.67 
 
 		 302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  55.19 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  52.74 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.31 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.08 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.78 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.85 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  31.84 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.63 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  32.86 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.7 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  32.52 
 
 		 353 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.7 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.7 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.97 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.55 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.11 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.67 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  27.21 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  31.84 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  27.39 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  33.73 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  29.36 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  25.09 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.44 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.48 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1317  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  49.3  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0437  Ribonucleoside-diphosphate reductase  20.98 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0071746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.48 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  22.95 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.45 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.92 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  25.09 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.23 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.96 
 
 		 352 aa  42.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>