49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4450 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  100 
 
 		 320 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  37.01 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  31.09 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.43 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.64 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.55 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  28.96 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  27.17 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  28.42 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31.5 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31.98 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  27.21 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  30.74 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  27.32 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.93 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.93 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.93 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.46 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  30.98 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.95 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  28.49 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.58 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.09 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70259  small subunit of ribonucleotide reductase  24.46 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  20.64 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2614  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.01 
 
 		 408 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.86 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.21 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1737  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.21 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.4 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.58 
 
 		 367 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  20.74 
 
 		 365 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.08 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.06 
 
 		 412 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0667  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.86 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0871304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1637  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.74 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2702  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.95 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.46 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.92 
 
 		 331 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.61 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.63 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.79 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.63 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  21.81 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  21.81 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1205  ribonucleotide reductase  23.57 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  21.56 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2528  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.6 
 
 		 412 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.506084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>