93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3061 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 		 312 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.23 
 
 		 312 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.74 
 
 		 312 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.74 
 
 		 312 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.74 
 
 		 312 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  81.15 
 
 		 314 aa  534  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.58 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  62.66 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  53.14 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  43.45 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.55 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.81 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  40.94 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.45 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.57 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  28.47 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  29.08 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  27.91 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  27.87 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  30.83 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  29.7 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.8 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  29.95 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  27.04 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  25.78 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.59 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.72 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2614  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.45 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2887  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.94 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.395919  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.4 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.37 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1637  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.99 
 
 		 403 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2638  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.19 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.66937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2702  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.19 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.37 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.03 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2528  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 412 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.506084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.53 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.53 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.63 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  26.67 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.62 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3158  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.73 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3664  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.18 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3460  amino acid adenylation  22.99 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.81 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4609  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.09 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2639  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.25 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2265  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.25 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247043  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3002  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.58 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.15 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12012  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.25 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3046  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.91 
 
 		 402 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2940  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.91 
 
 		 394 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0013  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.39 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0667  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.56 
 
 		 420 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0871304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16400  ribonucleotide reductase, beta subunit  25.39 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876136  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.53 
 
 		 330 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.94 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2804  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.91 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  0.329365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.63 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3087  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.91 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2636  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.91 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1737  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.94 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1154  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.85 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3274  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2509  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311533  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  24.22 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2788  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.08 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0430  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.897908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1289  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3473  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3511  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  24.21 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2288  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.98 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.439269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1975  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.83 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0400777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.98 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2469  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.93 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00438288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.94 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.7 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.94 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3292  Ribonucleoside-diphosphate reductase  20.96 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.05 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0205  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.28 
 
 		 394 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000182543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2103  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.15 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 411 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0293  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.6 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.078094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.61 
 
 		 415 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00871681  normal  0.016373 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0317  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.6 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.05 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>