43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1399 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  68.29 
 
 		 371 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  62.33 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  57.39 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  52.51 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  49.86 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  47.03 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  43.63 
 
 		 430 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  39.32 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  39.67 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  39.33 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  39.33 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  39.33 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  39.33 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  38.11 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  37.9 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  31.05 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  31.37 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  29.46 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  28.25 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  23.08 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  23.28 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  24.36 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  21.43 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  27.66 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  22.07 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  20.7 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  22.79 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  25.53 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  21.4 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  21.54 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  25.77 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  32.43 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  27.54 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  28.25 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>