33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2831 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  40.69 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  40.97 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  39.94 
 
 		 370 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  38.1 
 
 		 371 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  37.58 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  37.9 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  37.19 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  37.67 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  34.82 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  36.36 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  37.42 
 
 		 408 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  34.19 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  38.56 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  37.24 
 
 		 374 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  36.18 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  28.75 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  28.87 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  30.14 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1906  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  29.41 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  27.31 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  26.09 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  26.55 
 
 		 419 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  31.67 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>