34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6141 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  97.25 
 
 
327 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  97.86 
 
 
327 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  97.55 
 
 
327 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  97.55 
 
 
327 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  75.64 
 
 
327 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  75.64 
 
 
327 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  75.64 
 
 
327 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  75.64 
 
 
327 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  75.64 
 
 
327 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  75.08 
 
 
306 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  41.42 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  39.81 
 
 
360 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  39.63 
 
 
430 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  40.96 
 
 
371 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  38.15 
 
 
363 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  39.33 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  37.58 
 
 
370 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  37.18 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  33.87 
 
 
321 aa  175  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  30.82 
 
 
408 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  27.71 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  27.52 
 
 
378 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  27.71 
 
 
373 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  27.63 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  24.05 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  23.67 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  26.09 
 
 
422 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.08 
 
 
297 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  22.34 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  22.37 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  19.15 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  23.74 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>