59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0829 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  594  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  65.55 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  54.83 
 
 
308 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  50.52 
 
 
303 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  49.49 
 
 
303 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  46.6 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  45.48 
 
 
323 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  42.23 
 
 
305 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  42.23 
 
 
305 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  41.89 
 
 
305 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  41.55 
 
 
300 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  39.58 
 
 
310 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  40.28 
 
 
308 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  41.28 
 
 
301 aa  201  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  29.01 
 
 
345 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  30.17 
 
 
340 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  31.22 
 
 
335 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  28.39 
 
 
342 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  30.13 
 
 
340 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  32.42 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  32.42 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  26.46 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  28.19 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  26.46 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  26.46 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  28.38 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  29.56 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  30.25 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  31.75 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  30.47 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  26.07 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  26.39 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  27.66 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  26.17 
 
 
363 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  26.83 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  26.13 
 
 
370 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  24.69 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  22.68 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  22.34 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  22.34 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  22.34 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  22.34 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  24.26 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  23.21 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1211  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  22.14 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  22.87 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  22.87 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  22.87 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  22.87 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  22.87 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0688  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  25.2 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2413  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1743  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1136  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0779  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  26.27 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>