40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7420 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  97.55 
 
 
327 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  97.55 
 
 
327 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  97.86 
 
 
327 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  97.55 
 
 
327 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  76.6 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  76.6 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  76.6 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  76.6 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  76.6 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  76.08 
 
 
306 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  42.07 
 
 
372 aa  279  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  39.18 
 
 
360 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  39.94 
 
 
430 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  38.46 
 
 
363 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  40.96 
 
 
371 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  39.67 
 
 
369 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  37.9 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  36.86 
 
 
366 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  34.82 
 
 
321 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  32.08 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  28.03 
 
 
369 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  27.85 
 
 
378 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  27.68 
 
 
373 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  28.29 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  23.71 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  24 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  26.57 
 
 
422 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  22.68 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  22.7 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  19.29 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.48 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  23.74 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2779  hypothetical protein  26.17 
 
 
302 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294116  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  21.03 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  21.03 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  22.07 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  21.19 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  20.54 
 
 
299 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>