23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4508 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  841    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  47.01 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  30.75 
 
 		 396 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  25.16 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  32.65 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  24.35 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  24.35 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  24.35 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  24.35 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  24.35 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  24.35 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  26.57 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  26.09 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  26.09 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  26.09 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  26.09 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  22.56 
 
 		 372 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  26.02 
 
 		 366 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  25.77 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3618  hypothetical protein  25.11 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  25.79 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  27.36 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>