32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0711 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  76.08 
 
 
327 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  75.75 
 
 
327 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  75.75 
 
 
327 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  75.75 
 
 
327 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  75.08 
 
 
327 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  42.03 
 
 
372 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  41.61 
 
 
360 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  41.47 
 
 
430 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  39.32 
 
 
369 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  40.07 
 
 
363 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  39.86 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  38.31 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  41.61 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  37.67 
 
 
321 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  31.54 
 
 
408 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  28.91 
 
 
378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  27.12 
 
 
369 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  28.28 
 
 
373 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  26.67 
 
 
374 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  24.35 
 
 
422 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  28.43 
 
 
390 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  27.18 
 
 
303 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  21.28 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  23.21 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  23.39 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  20.22 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>