37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6502 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  97.55 
 
 		 327 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  99.39 
 
 		 327 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  97.25 
 
 		 327 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  99.39 
 
 		 327 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  76.28 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  76.28 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  76.28 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  76.28 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  76.28 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  75.75 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  42.39 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  38.87 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  39.94 
 
 		 430 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  38.46 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  40.61 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  39.33 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  37.9 
 
 		 370 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  36.54 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  34.19 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  31.45 
 
 		 408 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  28.03 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  27.85 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  27.68 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  27.06 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.69 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  24.05 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  24 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  26.09 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  23.36 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  22.34 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  23.23 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.51 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  19.5 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2779  hypothetical protein  26.17 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  22.44 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  21.52 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>