17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2642 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  805    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  30.75 
 
 
422 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  30 
 
 
390 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  23.77 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  23.23 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  23.74 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  23.74 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  23.74 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  23.39 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  23.39 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  23.39 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  23.39 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  23.39 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  23.74 
 
 
327 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.78 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  20 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  23.39 
 
 
306 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>