29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3268 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  787    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  66.21 
 
 
369 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  63.54 
 
 
373 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  62.5 
 
 
374 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  29.6 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  31.9 
 
 
370 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  31.05 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  28.91 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  28.91 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  28.91 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  28.91 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  28.91 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  28.91 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  29.26 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  30.38 
 
 
371 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  27.85 
 
 
327 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  29.24 
 
 
360 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  27.52 
 
 
327 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  27.85 
 
 
327 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  27.52 
 
 
327 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  29.62 
 
 
363 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  27.52 
 
 
327 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  30.81 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  28.68 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  36.18 
 
 
321 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  26.27 
 
 
299 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>