52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2088 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  54.36 
 
 		 305 aa  331  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  53.36 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  53.36 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  53.58 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  42.18 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  40.68 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  42.57 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  41.28 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  39.93 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  38.44 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  32.89 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  30.3 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  29.79 
 
 		 345 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  30.24 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  28.77 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  26.92 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  27.81 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  27.56 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  30.49 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  30.49 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  26.4 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  27.65 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  29.19 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  26.33 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  22.33 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  21.45 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  22.42 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  23.47 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  20.76 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  26.67 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  20.14 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  23.43 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  20 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  21.52 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  21.19 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  20.22 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  20.22 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  20.22 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  20.22 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  20.22 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  20.22 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  21.19 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  21.19 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  21.19 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>