51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1552 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  72.88 
 
 		 310 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  39.58 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  40.28 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  40.28 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  40.36 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  38.54 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  38.83 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  34.38 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  34.38 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  34.92 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  34.03 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  32.89 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  29.29 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  22.22 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  23.02 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  24.01 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  26.05 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  25.16 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  21.2 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  21.2 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  21.99 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  22.86 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  21.2 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  23.32 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  22.68 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  22.76 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  25.26 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  23.44 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  20.7 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  24.05 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  23.71 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  24.05 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  23.71 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  23.71 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  24.37 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  23.08 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  21.28 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  21.28 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  21.28 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  21.28 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  21.28 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  21.28 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  22.4 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  22.51 
 
 		 372 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>