31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4463 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  85.76 
 
 
342 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  85.49 
 
 
345 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  79.38 
 
 
340 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  62.14 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  60.19 
 
 
340 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  60.52 
 
 
335 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  51.91 
 
 
332 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  47.13 
 
 
329 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  45.22 
 
 
327 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  44.79 
 
 
329 aa  279  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  29.9 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  32.24 
 
 
299 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  26.96 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  26.96 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  26.96 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  26.46 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  27.59 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  27.3 
 
 
303 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  31.88 
 
 
303 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  27.21 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  27.73 
 
 
301 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  29.95 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  24.58 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  21.2 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  25.44 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  22.07 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  22.51 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  22.51 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>