32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1962 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  42.81 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  42.2 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  31.42 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  26.26 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  32.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  29.85 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  30.42 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  30.42 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  33.03 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  26.75 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  27.6 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  28.38 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  26.69 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  28.83 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  30.57 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  28.85 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  27.24 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  25.9 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  24.26 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  25.97 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  24.22 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  25.49 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  21.21 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  22.51 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  22.51 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  22.51 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  22.08 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  23.94 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  24.76 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>