32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1563 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  66.36 
 
 
329 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  68.06 
 
 
327 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  45.77 
 
 
345 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  45.54 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  45.87 
 
 
338 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  45.87 
 
 
338 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  45.87 
 
 
338 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  44.22 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  44.52 
 
 
335 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  39.49 
 
 
335 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  40.69 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  36.96 
 
 
332 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  28.33 
 
 
305 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  28.33 
 
 
305 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  28.33 
 
 
305 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  28.47 
 
 
300 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  28.38 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  27.81 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  26.21 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  24.28 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  25.42 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  24.14 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  22.22 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  24.17 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  27 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  24.26 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  24.26 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  22.51 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  24.54 
 
 
286 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>