18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1069 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  37.32 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  29.29 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  26.27 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  26.27 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  25.88 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  23.87 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  24.89 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  26.62 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  27.59 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  24.35 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  24.17 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  24.69 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  23.01 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  26.59 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  24.14 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  24.54 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>