47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  65.55 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  48.12 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  47.08 
 
 		 308 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  43.49 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  42.76 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  40.6 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  40.6 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  40.82 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  39.93 
 
 		 310 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  38.54 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  40.68 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  38.26 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  30.04 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  30.12 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  31.42 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  31.42 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  28 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  27.09 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  30.45 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  28.72 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  27.78 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  26.84 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  26.21 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  29.82 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  24.82 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  24.36 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  24.48 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  23.74 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  22.76 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  23.86 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  23.86 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  28.91 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  25.72 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  23.64 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  23.01 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  31.67 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  19.29 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  19.15 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  19.5 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  19.5 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  19.5 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>