45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9267 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  618  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  58.98 
 
 
303 aa  352  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  56.55 
 
 
303 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  54.83 
 
 
299 aa  311  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  47.08 
 
 
301 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  46.51 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  45.89 
 
 
299 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  41.36 
 
 
305 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  41.36 
 
 
305 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  41.02 
 
 
305 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  36.81 
 
 
310 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  38.64 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  38.54 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  38.87 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  27.27 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  26.57 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  31.47 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  27.33 
 
 
342 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  26.26 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  28.82 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  28.46 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  26.06 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  25.42 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  30.57 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  30.57 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  29.07 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  26.13 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  24.91 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  23.31 
 
 
369 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  22.96 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  23.75 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  24.35 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  27.69 
 
 
360 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  23.15 
 
 
370 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  24.26 
 
 
366 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  24.75 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  21.32 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  22.98 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  21.32 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  20.93 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  20.93 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  20.93 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>