24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0534 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  37.32 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  24.55 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  25.19 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  25.19 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  25.19 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  28.14 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  26.39 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  25.68 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  22.83 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  23.86 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  22.78 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  26.59 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  22.5 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  23.47 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  26.29 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  23.16 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  23.84 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  24.76 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  24.76 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  24.6 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  28.95 
 
 		 430 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>