32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2861 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  78.25 
 
 
340 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  76.05 
 
 
335 aa  548  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  62.14 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  62.14 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  62.14 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  62.18 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  60.32 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  59.49 
 
 
340 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  49.68 
 
 
332 aa  328  9e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  42.52 
 
 
327 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  40.69 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  39.49 
 
 
329 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  26.38 
 
 
299 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  26.48 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  28 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  25.48 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  26.92 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  26.38 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  26.38 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  29.56 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  26.06 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  28.15 
 
 
308 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  25.41 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  26.48 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  22.76 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  22.54 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  22.5 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  22.89 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  23.94 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  23.94 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  24.6 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>