31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1197 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  683    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  55.59 
 
 
340 aa  362  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  53.5 
 
 
342 aa  346  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  51.91 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  51.91 
 
 
338 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  51.91 
 
 
338 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  51.91 
 
 
338 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  50 
 
 
340 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  49.54 
 
 
335 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  49.68 
 
 
335 aa  328  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  36.96 
 
 
329 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  37.58 
 
 
327 aa  215  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  36.04 
 
 
329 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  30.82 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  30.82 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  30.5 
 
 
305 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  30.3 
 
 
301 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  27.27 
 
 
300 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  28.19 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  27.92 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  28.81 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  28.72 
 
 
301 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  29.07 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  31.5 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  25.33 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  27.92 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  24.92 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  24.01 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  28.85 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  28.85 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  23.61 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>