13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2779 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2779  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2149  hypothetical protein  23.49 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1376  hypothetical protein  23.1 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.133387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0431  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0383  hypothetical protein  23.03 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0518  hypothetical protein  21.94 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00400384  normal  0.0131254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  28.48 
 
 		 408 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0369  hypothetical protein  22.57 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.109009999999999e-20  unclonable  0.0000000552802 
 
 
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  35.38 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  26.17 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  26.17 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  29.82 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  29.82 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>