65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1382 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  63.54 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  59.7 
 
 
218 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  60.1 
 
 
208 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  57.59 
 
 
209 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  58.51 
 
 
225 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  52.75 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  52.69 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  54.84 
 
 
207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  48.33 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  44.21 
 
 
257 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  43.28 
 
 
232 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  55.78 
 
 
310 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  38.34 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  44.33 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  44.79 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  42.08 
 
 
235 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  40.76 
 
 
280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  43.08 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  32.68 
 
 
224 aa  121  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  41.44 
 
 
182 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  41.71 
 
 
208 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  39.04 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  42.53 
 
 
208 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  35.68 
 
 
446 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  42.53 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  38.33 
 
 
209 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  30.16 
 
 
203 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  36.46 
 
 
207 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  34.21 
 
 
213 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  34.62 
 
 
209 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  42.45 
 
 
231 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  32.16 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  41.35 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  39.67 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  32.11 
 
 
206 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  40.22 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  42.27 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  37.04 
 
 
152 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  34.46 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  27.47 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  38.76 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  36.87 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  32.97 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  34.46 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  32.56 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  36.56 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  30.56 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  39.87 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
414 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
396 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  34.01 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 
391 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
397 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
429 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  27.27 
 
 
401 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  22.94 
 
 
393 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
397 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
425 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  35.26 
 
 
370 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>