33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2813 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
414 aa  861    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  46.38 
 
 
393 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  46.81 
 
 
429 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  43.91 
 
 
425 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  42.82 
 
 
405 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
391 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
396 aa  296  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 
397 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  35.52 
 
 
401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
200 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  32.8 
 
 
200 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  30.57 
 
 
198 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
228 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
210 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
195 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  30.27 
 
 
186 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  36.43 
 
 
217 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  36.94 
 
 
225 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  36.94 
 
 
252 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  26.47 
 
 
180 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  32.2 
 
 
250 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 
207 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  33.94 
 
 
289 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  33.03 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  29.73 
 
 
218 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
221 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  31.43 
 
 
213 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>