26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1109 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  46.02 
 
 
228 aa  144  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  31.38 
 
 
198 aa  101  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  41.54 
 
 
397 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
397 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  31.18 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
429 aa  92.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
396 aa  91.3  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
425 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
414 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  31.35 
 
 
401 aa  88.6  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
391 aa  88.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  29.1 
 
 
405 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4470  hypothetical protein  26.88 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.9 
 
 
832 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1260  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  32 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3577  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  25.74 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3136  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  30.08 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3081  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 
239 aa  42  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>