44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0822 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
397 aa  828    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  57.68 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  38.65 
 
 
414 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  37.82 
 
 
401 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 
391 aa  275  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  37.7 
 
 
393 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  36.75 
 
 
405 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 
425 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  46.71 
 
 
429 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  31.98 
 
 
198 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
200 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
210 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  30.69 
 
 
200 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
228 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  41.54 
 
 
195 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  31.93 
 
 
236 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 
207 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  25.14 
 
 
194 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  39.73 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  29.13 
 
 
207 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  31.88 
 
 
225 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  30.39 
 
 
225 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
217 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3577  metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
133 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3163  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
201 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  30.6 
 
 
209 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
210 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  28.73 
 
 
446 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  27.18 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  30.4 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  29.52 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  24.86 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  28.93 
 
 
179 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
198 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
199 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  25.97 
 
 
180 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2828  metal dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 
219 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>