18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2414 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  40.93 
 
 		 429 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 		 425 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  36.02 
 
 		 405 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  38.42 
 
 		 393 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 414 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 397 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 397 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 396 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  29.1 
 
 		 401 aa  90.5  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 391 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  27.6 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4858  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1760  HD domain-containing protein  30.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>