30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3753 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  810    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 
414 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  46.35 
 
 
425 aa  342  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  46.77 
 
 
405 aa  338  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 
391 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 
396 aa  286  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  37.47 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  38.86 
 
 
401 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  63.43 
 
 
429 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  38.42 
 
 
200 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
200 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
228 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 
210 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  31.89 
 
 
198 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
195 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  28.26 
 
 
194 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  24.72 
 
 
236 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  27.33 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
207 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  25.84 
 
 
220 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  27.86 
 
 
152 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  24.14 
 
 
207 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  25.14 
 
 
208 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  26.32 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  32.84 
 
 
210 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  24.5 
 
 
204 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  25.93 
 
 
179 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>