59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4116 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  54.81 
 
 		 207 aa  150  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  46 
 
 		 203 aa  148  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  54.61 
 
 		 220 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  48.94 
 
 		 206 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  49.31 
 
 		 208 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  48.85 
 
 		 446 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  47.06 
 
 		 231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  43.48 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  38.36 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  42.25 
 
 		 208 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  42.75 
 
 		 208 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  40.71 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  39.86 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  40.97 
 
 		 209 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  39.16 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  39.01 
 
 		 226 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  39.71 
 
 		 228 aa  87  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  39.46 
 
 		 200 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  38.03 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  36.49 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  40.74 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  38.93 
 
 		 312 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  34.59 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  38.51 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  37.04 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  34.01 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  34.29 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  37.31 
 
 		 218 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  37.04 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  35.17 
 
 		 257 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  38.26 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  31.85 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  31.51 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  33.8 
 
 		 208 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  34.03 
 
 		 280 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  36.96 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  35.88 
 
 		 202 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  29.93 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  30.66 
 
 		 289 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  31.03 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  30.47 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  29.93 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  34.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  27.86 
 
 		 393 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  32.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 425 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  28.19 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  39.06 
 
 		 401 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 397 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>