46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2939 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  59.31 
 
 
257 aa  262  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  55.61 
 
 
242 aa  245  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  55.07 
 
 
280 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  53.39 
 
 
232 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  40.49 
 
 
217 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  40.54 
 
 
289 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  41.31 
 
 
252 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  37.57 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  41.27 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  41.83 
 
 
310 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  37.84 
 
 
289 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  41.8 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  41.09 
 
 
315 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  35.27 
 
 
300 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  38.74 
 
 
228 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  37 
 
 
228 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
207 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  37.11 
 
 
201 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  37.2 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  34.7 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  37.16 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  34.05 
 
 
208 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  34.59 
 
 
208 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  31.44 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  31.09 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  37.5 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  32.82 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  27.5 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  24.48 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  26.74 
 
 
446 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  29.17 
 
 
182 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  29.21 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  26.88 
 
 
215 aa  62  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  26.23 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  31.67 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  29.5 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  30.47 
 
 
152 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  27.37 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  31.05 
 
 
226 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  30.96 
 
 
200 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  27.62 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  26.82 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>