50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0838 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  57.96 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  53.74 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  50.22 
 
 
242 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  55.07 
 
 
235 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  42.55 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  33.48 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  40.76 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  37.93 
 
 
315 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  39.69 
 
 
225 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  36.65 
 
 
289 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  37.11 
 
 
201 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
207 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  38.53 
 
 
310 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  34.72 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  32.98 
 
 
289 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  33 
 
 
228 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  33 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  36.7 
 
 
312 aa  85.9  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  27.51 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  31.41 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  28.85 
 
 
207 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  30.14 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  30.65 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  25.71 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  28.06 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  32.96 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  31.67 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  27.22 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  28 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  33.81 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  27.05 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  34.03 
 
 
152 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  28.19 
 
 
446 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  30.05 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  26.41 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  28.44 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  27.84 
 
 
230 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  31.02 
 
 
200 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  25.52 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  25.95 
 
 
179 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  25.5 
 
 
209 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  25.95 
 
 
179 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  27.75 
 
 
204 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  23.87 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>