54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4748 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  39.62 
 
 
210 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  33.65 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  33.68 
 
 
208 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  28.86 
 
 
224 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  32.67 
 
 
220 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  31.67 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  32.07 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  30.05 
 
 
446 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  28.93 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  29.86 
 
 
250 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  30.19 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  33.15 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  32.8 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  30.56 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  29.44 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  29.23 
 
 
200 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  32.09 
 
 
182 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  27.4 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  29.35 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  32.06 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  28.72 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  26.74 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  29.35 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  25.94 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  29.8 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  27.59 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  25.68 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  25.4 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  28.65 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  28.16 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  24.65 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  31.87 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  27.47 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  25.67 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  30.96 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  26.4 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  27.05 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  27.23 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  28.22 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  27.49 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  24.44 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  24.19 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  26.88 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  23.12 
 
 
310 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  23 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  24.74 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  26.5 
 
 
280 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  24.88 
 
 
370 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  22.12 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  24.12 
 
 
312 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>