60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3381 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  57.65 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  52.76 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  39.11 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  49.31 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  42.93 
 
 		 446 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  38.65 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  38.2 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  45.74 
 
 		 225 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  41.86 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  42.61 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  38.54 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  40.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  40.19 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  37.63 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  34.74 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  41.28 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  38.1 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  40.93 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  33.68 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  40.91 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  36.78 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  41.85 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  32.54 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  38.05 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  34.83 
 
 		 289 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  40.82 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  32.86 
 
 		 232 aa  97.8  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  41.49 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  30.43 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  42.55 
 
 		 250 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  36.87 
 
 		 312 aa  94.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  37.8 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  38.32 
 
 		 315 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  34.83 
 
 		 289 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  34.5 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  37.97 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  32.55 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  35.64 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  30.73 
 
 		 280 aa  84.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  35.35 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  38.07 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  35.94 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  33.67 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  36.59 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  35.36 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  33.73 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  26.18 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  34.36 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4113  hypothetical protein  49.23 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 		 397 aa  51.6  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  32.63 
 
 		 280 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  26.47 
 
 		 393 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  30.66 
 
 		 405 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.180277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>