46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1219 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
397 aa  830    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  62.37 
 
 
396 aa  487  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 
397 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  40.29 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  38.8 
 
 
393 aa  289  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  38.48 
 
 
429 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  39.69 
 
 
405 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  38.01 
 
 
425 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  34.6 
 
 
401 aa  243  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  39.16 
 
 
198 aa  126  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  34.68 
 
 
200 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
228 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
210 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
200 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
195 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  30.57 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  28.65 
 
 
228 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  27.54 
 
 
315 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
207 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  27.88 
 
 
289 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  26.43 
 
 
207 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  28.03 
 
 
232 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  29.6 
 
 
217 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  34.62 
 
 
225 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  30.48 
 
 
208 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  32.26 
 
 
252 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1772  HDIG domain-containing protein  28.57 
 
 
220 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000373403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  33.64 
 
 
228 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  29.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  30.33 
 
 
220 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  26.83 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0221  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
211 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  29.23 
 
 
203 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  35.96 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  28.06 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  30.65 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  27.78 
 
 
257 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  28.28 
 
 
218 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  31.25 
 
 
236 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  26.62 
 
 
180 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  29.17 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1335  hypothetical protein  23.87 
 
 
305 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
210 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  30.21 
 
 
152 aa  43.1  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>