37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4476 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  87 
 
 		 228 aa  347  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  33.14 
 
 		 405 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 397 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 397 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  32.57 
 
 		 393 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 396 aa  96.7  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 		 414 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 429 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  30.98 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  27.53 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  29.63 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  29.52 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  31.13 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2828  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  32.11 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  31.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  29.1 
 
 		 446 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  29.89 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  28.16 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1260  metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1357  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2000  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.552544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5182  hypothetical protein  26.67 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  29.79 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  28.69 
 
 		 206 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  27.11 
 
 		 252 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  34.21 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>