27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2481 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  847    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  56.19 
 
 
425 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  46.04 
 
 
429 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  46.84 
 
 
393 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  43.07 
 
 
414 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  39.69 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
397 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  36.92 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  37.92 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  36.02 
 
 
200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
200 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  33.86 
 
 
198 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
210 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
228 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
195 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  26.67 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  25.31 
 
 
186 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  26.22 
 
 
194 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  30.25 
 
 
180 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  29.44 
 
 
204 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  26.26 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
207 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  28.31 
 
 
228 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  30.66 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  28.31 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>