28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2541 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
425 aa  891    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  56.9 
 
 
405 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
414 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  48.5 
 
 
429 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  46.04 
 
 
393 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 
391 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  34.62 
 
 
401 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 
397 aa  242  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  41.8 
 
 
200 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  40.8 
 
 
200 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  35.23 
 
 
198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
195 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  24.87 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  26.54 
 
 
194 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  28.4 
 
 
180 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  27.75 
 
 
203 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
221 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  28.09 
 
 
220 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  31.48 
 
 
225 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  30.71 
 
 
152 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
207 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  25.79 
 
 
315 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 
165 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.107883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>