32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1413 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
429 aa  895    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  48.12 
 
 
414 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  49.39 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  48.17 
 
 
425 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  46.76 
 
 
405 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  38.85 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 
396 aa  302  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
391 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
397 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  34.13 
 
 
401 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  40.82 
 
 
200 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
200 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
195 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
210 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
228 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  33.14 
 
 
198 aa  96.7  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  27.53 
 
 
186 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  30.25 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  29.63 
 
 
180 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  30.43 
 
 
220 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  29.35 
 
 
252 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  33.85 
 
 
217 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
199 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 
210 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  29.23 
 
 
236 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  22.66 
 
 
315 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1603  hypothetical protein  30.17 
 
 
211 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4276  hypothetical protein  36.07 
 
 
278 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
198 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
217 aa  43.5  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  27.91 
 
 
312 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>