65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5253 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  57.65 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  47.76 
 
 
207 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  45.3 
 
 
446 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  41.71 
 
 
203 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  40.58 
 
 
236 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  39.39 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  54.61 
 
 
152 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  42.06 
 
 
231 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  44.33 
 
 
208 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  44.85 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  44.69 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  35.41 
 
 
225 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  40.11 
 
 
179 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  38.66 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  40.11 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  40.11 
 
 
209 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  42.25 
 
 
200 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  40.72 
 
 
223 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  37.06 
 
 
204 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  38.12 
 
 
225 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  32.67 
 
 
215 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
207 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  39.04 
 
 
252 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  40.54 
 
 
228 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  36.71 
 
 
250 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  38.76 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  35.38 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  37.24 
 
 
300 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  36.63 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  32.58 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  35.14 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  36.06 
 
 
315 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  33.8 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  36.16 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  37.44 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  34.34 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  37.57 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  35.57 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  32.81 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  32.86 
 
 
226 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  32.12 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  30.14 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  29.47 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  32.78 
 
 
289 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  33.69 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  26.67 
 
 
405 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  37.5 
 
 
310 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4113  hypothetical protein  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  32.87 
 
 
370 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  29.17 
 
 
280 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
396 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  27.87 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
429 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  25.84 
 
 
393 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
425 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
414 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
397 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  29.3 
 
 
389 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  25 
 
 
401 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>